马俊才照片

马俊才博士

现任中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心主任、世界微生物数据中心 WDCM 主任、世界微生物藏联合会理事、科技部人类遗传资源管理专家委员会委员、中国生物工程学会生物技术与生物产业信息委员会主任委员、中国生物技术与生物产业信息联盟秘书长。

目前开展的工作

1、长期从事于微生物资源和生物技术领域信息化工作:作为项目负责人,主持中国科学院典型培养物委员会信息平台、中国科学院应用微生物研究网络信息平台、全国科学院联盟微生物分会信息平台、中国生物技术与生物产业信息平台的设计与开发。目前上述信息平台已经成为我国微生物领域和生物技术领域最重要的信息平台之一,通过信息化手段有效地推动我国微生物资源的信息共享和生物技术成果的转移转化。

2、作为国家 863 计划首席科学家,开展我国微生物大数据平台建设:作为国家 863 计划《微生物数字化信息系统集成关键技术的研发》项目的首席科学家,主持我国 28 个科研机构共同开展微生物大数据平台建设,面向微生物资源、微生物技术开发和微生物产业应用的重大需求,以微生物领域相关的数字化资源整合为核心,重点突破异构化微生物数字资源整合、大规模组学数据集成及分析、针对微生物数字资源的知识挖掘和垂直检索、基于云技术的微生物信息系统构建等关键技术;研究制定微生物数字资源整合的数据标准和服务标准;建立微生物领域完善的数据体系及知识仓库;开发支持微生物数字化资源获取、存储、挖掘、共享和应用的协同服务平台及分析软件;形成微生物数据整合与应用的典型示范。

3、作为世界微生物数据中心主任,主持微生物领域最大的国际数据合作:世界微生物数据中心(World Data Center for Microorganism, WDCM)成立于 1966 年,隶属于世界微生物菌种保藏联合会WFCC 和联合国教科文组织下的全球微生物资源中心网络,是全球微生物领域最重要的实物资源数据中心。2010 年经过全球竞争,世界微生物数据中心(WDCM)正式落户于中国科学院微生物研究所,是落户于我国生命科学领域的第一个世界数据中心,目前全世界 75个国家的 722微生物资源保藏中心在 WDCM 注册。WDCM 落户中国后,我们倡导了全球微生物资源目录国际合作计划(Global Catalogue of Microorganism, GCM),旨在为分散于全球各个保藏中心和科学家手中宝贵的微生物资源提供一个全球统一的数据仓库和实物资源目录, 为全世界科技界和产业界提供微生物资源信息服务。目前已经有来自美国、法国、德国等 43国家 111际微生物资源中心正式加入,39株微生物实物资源的信息汇集到中国团队开发的数据平台。这是国际微生物领域由我国科学家倡导实施并获得广泛响应的重要国际数据合作计划,摸索了一套整合全球微生物资源数据的有效机制,促进了微生物资源数据的全球共享利用,也确立了我国在微生物资源数据共享方面的引领地位。

4、积极引领生物多样性公约和名古屋议定书在微生物领域的国际合作:作为世界微生物数据中心主任,在微生物领域积极引领和推进微生物领域的相关国际合作,分别于 2013 年、2014 年和2015年组织召开了微生物领域生物多样性公约和名古屋议定书实施的国际研讨会,微生物领域多位著名科学家、中国国家环保部官员、生物多样性公约总部法律顾问等参加,研究制定微生物领域实施策略、信息平台建设、如何与CBD 总部信息平台对接。在 2014 年 10 月在韩国将举行第十二届生物多样性公约缔约方大会( COP 12)上,主持了以 Global Catalogue of Microorganisms(GCM): A global information platform for accessing, tracking, monitoring and benefit sharing of microbial resources 为题目的国际研讨会。

文章

(1)、马俊才,刘斌,吴林寰,杜晓萌,孙清岚,王楠。利用科研信息化手段推动微生物研究与应用。中国科学院院刊,2013,28(4):519-524。

(2)、Wu L, Sun Q, Desmeth P, Sugawara H, Xu Z, McCluskey K, Smith D, Alexander V, Lima N, Ohkuma M, Robert V, Zhou Y, Li J, Fan G, Ingsriswang S, Ozerskaya S, Ma J*. World data centre for microorganisms: an information infrastructure to explore and utilize preserved microbial strains worldwide. Nucleic Acids Research. 2017 Jan 4;45(D1):D611-D618.

(3)、吴军,刘翟,马俊才。提高用户满意率的服务器主动调度算法。小型微型计算机系统,2013,34(7):1534-1536。

(4)、Wu LH, Sun QL, Sugawara H, Yang S, Zhou YG, McCluskey K, Vasilenko A, Suzuki KI, Ohkuma M, Lee Y, Robert V, Ingsriswang S, Guissart F, Philippe D, Ma JC*. Global catalogue of microorganisms (gcm): a comprehensive database and information retrieval, analysis, and visualization system for microbial resources. BMC GENOMICS. 2013, 14:933.

(5)、Meng Zhen, You Xiaoyan, Jiang Chengying, Ma Juncai*. Homology Modeling for Sulfur Oxygenase/Reductase. Chinese Journal of Applied and Environmental Biology. 2010, 16(3):424-428.

(6)、Shi WF, Li W, Li XB, Haywood J, Ma JC*, Gao GF, Liu D. Phylogenetics of varied subtypes of avian influenza viruses in China: potential threat to humans. PROTEIN & CELL. 2014, 5(4):253-257.

(7)、Cui LB, Liu D, Shi WF, Pan JC, Qi X, Li XB, Guo XL, Zhou MH, Li W, Li J,Haywood J, Xiao HX, Yu XF, Pu XY, Wu Y, Yu HY, Zhao KC, Zhu YF, Wu B, Jin T, Shi ZY, Tang FY, Zhu FC, Sun QL, Wu LH, Yang RF, Yan JH, Lei FM, Zhu BL, Liu WJ, Ma JC*,Wang H, Gao GF. Dynamic reassortments and genetic heterogeneity of the human-infecting influenza A (H7N9) virus. NATURE COMMUNICATIONS. 2014, 5:3142.

(8)、Robert Vincent, Vu Duong, Amor Ammar Ben Hadj, van de Wiele Nathalie, Brouwer Carlo, Jabas Bernard, Szoke Szaniszlo, Dridi Ahmed, Triki Maher, Ben Daoud Samy, Chouchen Oussema, Vaas Lea, de Cock Arthur, Stalpers Joost A, Stalpers Dora, Verkley Gerard J M, Groenewald Marizeth, Dos Santos Felipe Borges, Stegehuis Gerrit, Li Wei, Wu Linhuan, Zhang Run, Ma Juncai*, Zhou Miaomiao, Gorjon Sergio Perez, Eurwilaichitr Lily, Ingsriswang Supawadee, Hansen Karen, Schoch Conrad, Robbertse Barbara, Irinyi Laszlo, Meyer Wieland, Cardinali Gianluigi, Hawksworth David L, Taylor John W, Crous Pedro W. MycoBank gearing up for new horizons. IMA fungus. 2013, 4(2):371-379.

(9)、Liu D, Shi WF, Shi Y, Wang DY, Xiao HX, Li W, Bi YH, Wu Y, Li XB, Yan JH, Liu WJ, Zhao GP, Yang WZ, Wang Y, Ma JC*,Shu YL, Lei FM, Gao GF. Origin and diversity of novel avian influenza A H7N9 viruses causing human infection: phylogenetic, structural, and coalescent analyses. LANCET. 2013, 381(9881):1926-1932.

(10)、Hu YF, Yang X, Qin JJ, Lu N, Cheng G, Wu N, Pan YL, Li J, Zhu LY, Wang X, Meng ZQ, Zhao FQ, Liu D, Ma JC*, Qin N, Xiang CS, Xiao YH, Li LJ,Yang HM, Wang J, Yang RF, Gao GF, Wang J , Zhu B. Metagenome-wide analysis of antibiotic resistance genes in a large cohort of human gut microbiota. NATURE COMMUNICATIONS. 2013, 4:2151.

授权发明专利

(1)、孙清岚,田佳贺,马俊才, 带应用软件界面的电脑, 2015.7.22,中国, ZL201530006651.7

(2)、李晶,孙清岚,刘文军,马俊才,一种基于流感病毒刺激的细胞差异基因数据分类系统,2014.11.19,中国,201410294369.8

会议特邀学术报告

(1)、马俊才,Introduction of WFCC - MIRCEN World Data Centre for Microorganisms,2015马来西亚保藏中心大会, 马来西亚, 2015.8

(2)、马俊才,WDCM activities and database, BIO Asia大会, 日本, 2015.3

(3)、马俊才,The prototype of Connection of WHO PIP framework database to WDCM Global Catalogue System, WHO-大流行性流感的防范(PIP)顾问组会议, 瑞士, 2015. 4

(4)、马俊才, 世界微生物数据全球合作, “一带一路”微生物领域中俄双边科技合作研讨会,俄罗斯, 2016.7

(5)、马俊才, “WDCM information platform for data integration”(WDCM信息平台在数据整合方面的应用), 国际标准化组织/生物技术标准化技术委员会(ISO/TC 276)第四次全体会议及工作组会议, 美国, 2016.5

(6)、马俊才, Microbial resources data—specification on data management and publication in microbial resources centre, 国际标准化组织/生物技术标准化技术委员会ISO 276爱尔兰大会, 爱尔兰, 2016. 10

(7)、马俊才, “WDCM and global catalogue of micro-organisms and its possible role in supporting traceability of microbial genetic resources”, 泰国微生物管理及应用培训班和研讨会,泰国,2016.2